مهمترین آثاری که به قلم شهید سید مرتضی آوینی منتشر شده، عبارتند از:
گنجینه آسمانی (متن گفتارهای مجموعه مستند روایت فتح) / سیدمرتضی آوینی /
کانون فرهنگی هنری ایثارگران و موسسه فرهنگی روایت فتح / 1376.
ـ توسعه و مبانی تمدن غرب / سیدمرتضی آوینی / نشر ساقی / 1376.
ـ آینه جادو (جلد 1: مقالات سینمایی) / سیدمرتضی آوینی / نشر ساقی / 1377.
ـ آینه جادو (جلد 2: نقدهای سینمایی) / سیدمرتضی آوینی / نشر ساقی / 1377.
ـ آغازی بر یک پایان / سید مرتضی آوینی / نشر ساقی / 1378.
ـ آینه جادو (جلد 3: گفتوگوها، سخنرانیها و مقالات سینمایی) / سیدمرتضی آوینی /
نشر ساقی / 1378.
ـ امام (ره) و حیات باطنی انسان / سیدمرتضی آوینی / روایت فتح / 1378.
ـ فردایی دیگر (مجموعه مقالات) / سیدمرتضی آوینی / برگ / 1378.
ـ حلزونهای خانه بهدوش / سیدمرتضی آوینی / نشر ساقی / 1379.
ـ رستاخیز جان / سیدمرتضی آوینی / نشر ساقی / 1379.
ـ فتح خون (روایت محرم) / سیدمرتضی آوینی / نشر ساقی / 1379.
ـ یک تجربه ماندگار (روایت فتح به روایت شهید سیدمرتضی آوینی) / سیدمرتضی آوینی /
روایت فتح / 1379.
ـ با من سخن بگو دوکوهه (گفتار متن برنامه روایت فتح) / سیدمرتضی آوینی/ روایت فتح /
1380.
ـ مرکز آسمان / سیدمرتضی آوینی / روایت فتح / 1380.
ـ حکومت فرزانگان (مروری بر مبانی حاکمیت سیاسی در اسلام) / سیدمرتضی آوینی /
موسسه فرهنگی هنری شهید آوینی و نشر غنچه / 1382.